美国政府于5月13日再次削减哈佛大学的联邦资金，在此前基础上进一步削减了4.5亿美元。多个美国联邦机构组成的打击反犹主义联合工作组发表声明，指出哈佛校园存在严重问题，学校领导层未能追究责任，屡次未能应对校园内广泛存在的种族歧视和反犹主义等问题。因此，哈佛大学已失去获得纳税人支持的资格，现任政府的8个联邦机构宣布终止向哈佛提供约4.5亿美元的资助，这是在此前终止的22亿美元资助基础上的进一步削减。

3月底，联合工作组表示将审查拨给哈佛大学及其附属机构的约90亿美元联邦资金。4月11日，美国政府官员致信哈佛大学，要求学校进行有意义的治理改革与重组，否则联邦资金将被削减。4月14日，哈佛大学拒绝了这一要求。随后，美国政府宣布冻结对该校总额22亿美元的多年期拨款以及6000万美元的多年期合同款项。此外，美国政府还威胁取消哈佛大学招收国际学生的资质、考虑剥夺其免税地位，并对哈佛大学发起多项调查。哈佛大学于4月21日对美国政府提起诉讼，指控政府试图以冻结联邦资金为手段操纵哈佛大学的学术决策。

美国教育部长琳达·麦克马洪在5月5日表示，哈佛大学未能按照此前联邦政府提出的要求进行改革，联邦政府将不再对其提供新的资助。自今年1月以来，美国政府对多所美国高校发出威胁，声称如果校方不调整政策，将面临削减资金的后果。政府的主要要求包括根除校园内的反犹主义、废除高校向少数族裔倾斜的多元化举措等。