当地时间7月14日，韩国内乱特检组对军方无人机作战司令部、国防部防间谍司令部和国防部情报本部进行了扣押搜查。7月10日凌晨，韩国首尔中央地方法院批准了内乱特检组对尹锡悦提出的逮捕申请，并签发了对前总统尹锡悦的逮捕令。尹锡悦随即被当场收押，这是他自今年3月8日被法院决定取消拘留以来，时隔124天再次被拘留。

此前在7月6日，负责调查紧急戒严事件的特检组以涉嫌滥用职权等为由，提请法院批捕尹锡悦。尹锡悦被捕后，特检组将对其进行最长20天的调查。特检组表示，尹锡悦涉嫌妨碍执行特殊公务、违反《总统警卫法》、滥用职权、伪造公文等多项罪名。由于提请批捕书中列明的内乱罪相关嫌疑在检方、警方调查阶段已得到一定证实，预计之后的调查将集中于尹锡悦的外患罪嫌疑，包括涉嫌为宣布戒严制造理由，派无人机侵入朝鲜首都平壤，以挑衅朝方。