美国政府于5月22日宣布取消哈佛大学的学生和交流学者项目资质，禁止该校招收国际学生。哈佛大学回应称，这一行动可能对学校社区和国家造成严重损害。

根据美国国土安全部的声明，该决定是对全国所有大学和学术机构的警告。声明指出，由于哈佛大学屡次违反联邦法律，其招收国际学生的特权已被撤销。现有国际学生必须转学，否则将失去合法身份。学生和交流学者项目由国土安全部下属机构管理，招收外国留学生和交流学者的美国学校均需获得相关资质。

哈佛大学随后发表声明，指出特朗普政府的行为非法且有害，并表示正在迅速行动为社区成员提供指导和支持。哈佛大学的国际学生和学者来自140多个国家，为学校乃至整个国家带来了巨大财富。截至2023年秋季学期，国际学生占哈佛学生总数的27%以上。

在本轮巴以冲突背景下，美国多地高校去年爆发了一系列支持巴勒斯坦的抗议活动。自今年1月以来，美国政府要求多所顶尖高校调整政策，根除所谓的反犹主义，废除向少数族裔倾斜的招生政策等举措，否则将面临削减资金的后果。哈佛是美国最古老、最富有的大学之一。

3月底，打击反犹主义联合工作组表示将审查拨给哈佛大学及其附属机构的约90亿美元联邦资金。4月11日，美国政府官员致信哈佛大学，要求进行“有意义的治理改革与重组”，否则联邦资金将被削减。4月14日，哈佛大学拒绝了政府的要求。美国政府随即宣布冻结对该校总额22亿美元的多年期拨款及6000万美元的多年期合同款项。4月21日，哈佛大学将美国政府告上法庭，指控政府试图操纵学校的学术决策。5月5日，美国教育部长琳达·麦克马洪表示，哈佛大学未能按照联邦政府提出的要求进行改革，联邦政府将不再对其提供新的资助。5月12日，哈佛大学校长艾伦·迈克尔·加伯发表公开信，称哈佛不在民主党和共和党之间“站队”，已采取措施根除校园中的反犹主义。他表示，哈佛遵守法律，而政府试图控制哈佛基础运营的一系列举措违法。5月13日，美国政府宣布将在先前冻结对哈佛大学的22亿美元多年期拨款基础上，再取消4.5亿美元拨款。哈佛大学则在当天晚些时候向法院提交新的诉讼要求。此外，美国政府还威胁剥夺哈佛大学的免税地位，并对哈佛大学发起多项调查。

特朗普政府以“反犹主义”指控为由，威胁要调查数十所大学，并停止向哥伦比亚大学、康奈尔大学、西北大学和普林斯顿大学等高校拨款。3月，美国政府撤销了对哥伦比亚大学4亿美元的联邦拨款。几周后，哥伦比亚大学作出妥协，同意按照政府要求推行一些改革。尽管如此，美国教育部长麦克马洪仍拒绝透露何时或会否恢复对该校的拨款。受此影响，哥伦比亚大学本月宣布裁员近180人。美国大学教授协会已在联邦法院提起诉讼，控告美国政府撤销联邦拨款的行为违法。除哈佛大学和哥伦比亚大学外，康奈尔大学和西北大学等高校的联邦拨款也被冻结。